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先天性肠闭锁可出现典型的肠梗阻症状，主要表现为胎儿期母亲羊水过多，出生后患儿出现呕吐、腹胀、胎粪排出异常等情况。怀孕期间母亲羊水过多主要是因为胎儿肠闭锁以后，胎儿吞咽的羊水无法顺利进入闭锁远端的肠管，从而导致羊水过多。出生后呕吐主要呕吐的物质为黄绿色液体，胎便一般不排或仅排出灰白色的不正常胎便。部分患儿如果闭锁的肠管比较接近结肠，会出现明显的腹胀。如果闭锁的肠管离十二指肠比较近，一般腹胀不是很明显。如果闭锁的肠管过于膨胀，出现穿孔等并发症，则患儿的全身情况会迅速恶化，出现感染性休克、弥漫性腹膜炎等比较严重的表现。