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血液滤过的方法与血液透析类似，即通过血滤器将体内血液引出，血液经过血滤器，可将有害物质、多余的水和电解质排出体外，并将所需的电解质以置换液的形式输回体内。由于血滤器的滤膜孔径比较大，因此，血液滤过是清除体内大分子、中分子的主要方式，体内的中分子物质大约有几百种，目前所知的有害成分包括β2微球蛋白、PTH、瘦素等。