草果仁味辛性温，有温中健胃，消食顺气，祛寒湿的功能，并能解酒毒，去口臭。果实入药能治心腹疼，食积不消，止泻，呕吐，食欲不佳，咳嗽痰多，胸满腹胀等症。
1、草果仁治瘟疫初起，先憎寒而后发热，日后但热而无憎寒，初起二、三日，其脉不浮不沉而数，昼夜发热，日哺益甚，头身疼痛:槟榔10克，厚朴5克，草果 仁2。5克，知母5克，芍药5克，黄芩5克，甘草2。5克。用水一钟，煎八分，午后温服。(<瘟疫论>达原饮)
2、草果仁治疟疾，胃中寒痰凝结，不易开解:草果、常山、知母、乌梅、槟榔、甘草、穿山甲。水煎服。(<慈幼新书>草果饮)
3、草果仁治瘅疟，脉采弦数，但热不寒，或热多寒少，膈满能食，口苦舌干，心烦，渴水，小便黄赤，大腑不利:青皮(去白)、厚朴(姜制炒)、白术、草果 仁、柴胡(去芦)、茯苓(去皮)、半夏(汤泡七次)、黄芩、甘草(炙)各等分。细锉。每服20克，水一盏半，姜五片，煎至七分，去滓，温服，不拘时候。 (<济生方>清脾汤)
4、草果仁治脾痛胀满:草果仁二个。酒煎服之。(<仁斋直指方>)
5、草果仁治肠胃冷热不和，下痢赤白，及伏热泄泻，脏毒便血:草果子、甘草、地榆、枳壳(去穰，麸炒)。上等分为粗末。每服10克，用水一盏半，煨姜一块，拍碎，同煎七分，去滓服，不拘时候。(<传信适用方>草果饮)
6、草果仁治肿寒疟疾不愈，振寒少热，面青不食，或大便溏泄，小便反多:草果仁、附子(炮，去皮脐)。上等分，细锉。每服25克，水二盏，生姜七片，枣一枚，煎至七分，去滓温服，不拘时候。(<济生方>果附汤)