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扁桃体癌的病因主要包括以下几个方面：1、吸烟：各种烟草制品包括电子烟，都可以导致咽喉部癌症，其中也包括扁桃体癌，吸烟是一个重要的危险因素；2、饮酒：研究证实，饮酒也是扁桃体癌的独立危险因素，尤其是长期高度饮酒，特别是白酒，这会增加癌症发生的概率；3、 HPV感染：人乳头瘤状病毒即HPV的感染也可以引起扁桃体癌。特别是在西方国家，不正当的经口性行为等可能导致病毒在口腔内繁殖，尤其是高危型的HPV16和HPV18，会增加扁桃体癌的风险；4、槟榔嚼食：在南方地区，尤其是湖南等地，许多人喜欢嚼槟榔，长期嚼食槟榔后，槟榔汁会刺激咽喉部和扁桃体，增加扁桃体癌的发生风险。此外，研究也证实胃酸反流与扁桃体癌变有关，随着年龄的增长，胃食道括约肌会松弛，导致胃酸反流到食道上方，长期刺激扁桃体，也会引发扁桃体癌的发生。