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脑干梗塞最佳治疗越早越好。因为脑细胞需要的氧气和能量来自血液，自身没有存储，所以对于缺血的耐受性特别差。如果阻断脑组织供血动脉，几分钟就会发生脑细胞的不可逆死亡。因此越早开通闭塞动脉，恢复供血，治愈的可能性就越大，无论是脑干还是其它部位都是如此。所以时间就是大脑。目前最好的治疗公认是溶栓，还有取栓治疗，但溶栓治疗有时间限制，目前限制在4.5小时以内，必须要把溶栓药物输入进静脉，如果超过时间窗再去溶栓，出血的风险就会明显增加。所以脑干梗塞，尤其是供应脑干的基底动脉闭塞，引起的梗塞症状会比其它部位更严重，预后也会比其它部位更差。脑干的溶栓和取栓时间在临床上可以适当延长，但无论是哪儿的梗塞都越早越好。