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新生儿心肌酶高，主要的原因可能是以下几个方面：1、感染：比如心脏发生感染、全身血液循环系统发生感染，导致心脏受损；2、先天性心脏病：先天性心脏病也可导致心肌酶高，要明确先天性心脏病的病因，是不是需要进行积极治疗，是手术治疗，还是保守治疗；3、先天性发育不全：比如肾脏发育不全、肝脏发育不全、胆道系统发育不全，都会导致心肌的损伤，比如肾脏发育不全，肾脏功能不全就不能将毒素及时排出，肝脏功能不好，不能对人体的毒素进行解毒，胆道系统发育不全，胆红素在血液循环里大量淤积。这3方面的毒素，都会对心脏的功能造成一定的损伤，导致心肌酶增高。所以，一旦出现心肌酶增高，需要判断新生儿心肌酶增高的原因，对这个原因进行对症的干预治疗，才能够纠正心肌酶的变化，修复心肌的损伤。这个过程可能需要消耗1周，甚至更长的时间。