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甲状腺癌诊断方法主要包括医师体格检查、病理学诊断以及肿瘤标志物，包括甲状腺肿瘤特异性标志物，例如甲状腺球蛋白或降钙素。体格检查是专业医生对甲状腺的触诊，可以通过触诊了解甲状腺位置、大小、形态以及甲状腺内部是否存在异常占位，包括肿物位置、大小、形态、与周围组织器官的关系和活动度等，还可以了解颈部淋巴结情况。 而影像学检查可以更加精确了解疾病情况，包括B超检查，而B超检查相对无创、安全，灵敏度较高。此类在甲状腺癌早期发现和诊断中发挥重要作用，可以了解病灶位置、大小、形态以及病灶与周围组织器官的侵犯情况，同时可以了解颈部淋巴结转移情况，为手术方案选择提供重要依据。而CT和磁共振显像是解剖显像，可以更加清晰直观地了解病灶位置以及与周围组织器官的侵犯情况，同时可以了解淋巴结转移情况，也为手术方案选择提供重要依据。 核医学检查包括核医学功能显像以及PET-CT显像，此类显像方法具有较多优势，与其它影像检查可以互相弥补，例如PET-CT检查可以了解甲状腺癌全身疾病分布情况，同时可以发现较隐匿病灶。而甲状腺癌术后和碘-131治疗后，如果复发，可以探测到潜在的隐匿病灶。而各种影像检查都是优势互补，可以根据临床需要选择不同的检查手段。 血液中存在特异肿瘤标志物，例如甲状腺球蛋白，属于分化型甲状腺癌较特异的标志物，尤其在甲状腺癌术后、碘-131治疗后，球蛋白升高是甲状腺癌复发或进展的标志物。而降钙素是甲状腺髓样癌的重要标志物，也是在甲状腺髓样癌的早期诊断以及术后监测复发或疗效判断的重要血液肿瘤标志物。