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早上起来咳嗽的原因包括：1、多数情况下可能为晚间睡眠时咽喉部较干燥，加之体位变动，可能会对咽喉部产生刺激；2、晚间睡眠咽喉部，即上呼吸道、胃肠道反流可能会蓄积在上呼吸道或咽喉部，体位变动可能会使反流物误入呼吸道，产生对呼吸道的刺激；3、可能为夜间蓄积在上呼吸道或呼吸道中的痰液，随着体位变动刺激气管、支气管、喉部的黏膜而产生咳嗽的症状。大多数情况下晨起后咳嗽有一定好处，可将夜间蓄积的分泌物排出，避免上呼吸道和下呼吸道感染。但如果咳嗽较严重，通常需到医院排查是否有感染、过敏以及理化因素的刺激，必要时需依据晨起咳嗽是否伴有痰液以及痰液的颜色等采取相应治疗。当患者症状及病因不明确时，可口服止咳化痰、清热解毒的药物，还需多饮水、休息，避免理化因素以及辛辣食物的刺激，可使晨起后的咳嗽得到缓解。