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灰质异位癫痫手术效果确切，有效率可达到80%以上。只要精准定位结节，通过热凝或手术切除方法，即可达到完全根治。但癫痫手术并不像肿瘤手术，真正评估手术是否成功，需要等待两年时间，如果术后早期仍有发作现象，可进行持续药物治疗，直到脑电图检查放电现象缓解。若术后2年癫痫未发作，且脑电图也不放电，则证明已得到完全根治。