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在胚胎发育过程中，神经元迁移异常，不能迁移到大脑表面的正常部位，称为灰质异位。神经元应逐渐从脑室周围的室管膜下开始迁移，但由于迁移过程中出现停留，或聚集在室管膜下，形成异常神经元，而导致异常放电，引起癫痫，甚至可达到70%-80%的概率。若癫痫发作时期较早，还会导致认知、智力、语言等功能障碍。但若灰质异位范围较小，且癫痫发作年龄也较晚，可能对智力影响较小。