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临床上，脑脊液化验检查是一项重要的检查，通常包括脑脊液生化、脑脊液常规和普通细菌培养。 脑脊液生化主要检查脑脊液内糖、蛋白以及氯化物的含量；脑脊液常规主要检查脑脊液的外观、细胞数等；脑脊液内免疫学检查适用于检测脑脊液内是否有寄生虫感染。 另外，还有专门针对特殊细菌的检查，如可以通过扩增DNA或RNA检查是否有结核菌相应感染等。