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小肠镜检查操作较为复杂，所以相比大肠镜检查其价格较高。大肠镜的检查费用约为300元，小肠镜的检查费用约为5000元。小肠镜检查由于医生操作时间较长并且耗材较大，费时费力。小肠镜检查对观察小肠的病变，起到至关重要的作用。目前观察小肠病变也可以通过胶囊小肠镜，这种方法患者舒适度更高，但胶囊小肠镜与肠镜检查存在区别，建议患者遵从专业医生的诊疗方案。