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脑干肿瘤手术后遗症较多，临床并发症出现的几率比其他部位的肿瘤相对较高，侵犯的部位不同、损伤神经的核团区域不同、损伤的神经传导通路的不同会产生不同的并发症。比如眼球运动障碍、面瘫等，较重的包括肢体瘫痪、呼吸的功能的障碍等。若出现呼吸功能障碍并发症概率较大，医生和家属应慎重做出决定，若是神经功能障碍，可通过后期神经功能自我康复。