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胃肠道间质瘤的引发病因尚不明确，因此对患者的饮食方面没有明确的禁忌。贲门位置或幽门位置等特殊部位的间质瘤，若出现梗阻会导致患者无法进行正常的饮食，需要及时通过手术处理，且对术后的胃肠道间质瘤患者没有明确的饮食禁忌，但因胃肠道经过改造手术，一般建议患者注意避免进食较坚硬或是难以消化的食物。