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矮小症的诊断一般用百分位法和标准差法，百分位法和标准差法都用一个诊断数据表。孩子在同年龄、同种族、同性别的情况下，临床上诊断身高＜3个百分位的情况下，或标准差法＜2个单位、2个标准差的情况下，便诊断为矮小症。一般到门诊来就诊的患者会说孩子上幼儿园了，比班上的孩子小很多，一般一个孩子1年长＜4cm以下，也要诊断矮小症。也有家长来了以后，说最近孩子没怎么长，具体没有做统计，但是几乎没长个子，这种也可以叫生长发育延迟或迟缓诊断为矮小症。标准前提是＜3个百分位和＜2个标准差。