南浔区中医院成立于1952年，前身为南浔镇卫生院，经过几代职工六十多年的艰苦努力，现已发展成为国家二级甲等中医院。医院现有职工325人，其中高级职称32人，中级职称74；卫技人员281，其中中医类人员80人（中医32人，中药10人，西学中38人），中医类人员占比卫技人员比例28.83%。现有市级名中医1人，省基层名中医2人，区级名中医3人。当时按照中心卫生院规模建设于1999年整体搬迁使用至今。2017年10月医院更名为湖州市南浔区中医院，新医院正在规划筹建中。医院曾多次被评为国家、省、市级先进集体、文明单位，时任全国人大副委员长彭珮云（2001年）、卫生部部长陈敏章（1996年）、副部长王陇德等领导多次来院视察，彭珮云副委员长现场题词“中西医结合好”。医院同时也是南浔镇社区卫生服务中心，下辖32家社区卫生服务站，承担着本地区人民群众的医疗卫生、预防保健、功能康复、科研教学、社区卫生服务和全区中医指导等工作。2016年4月历时一周拍摄专题片“身边的15分钟健康服务”在CCTV4“走遍中国”栏目播出。2017年3月，治未病中心被《环球杂志》“健康中国2030课题报告”刊发报道。

医院科室设置齐全，目前实际开放床位206张，分妇科、外科、骨科、内科、儿科等六个病区。门诊科室中医特色明显，独立设置国医馆和治未病中心，包括名医工作室、针灸治疗科、推拿按摩科、中药熏喷室等其他科室；其他内科、儿科、外科、骨科、妇产科、五官科、口腔科、皮肤科、泌尿外科、肛肠外科、犬伤等门诊设置齐全。近几年医院加强基础设施建设，加大设备的投入，引进GE公司16排CT、富士双板DR、飞利浦彩超、日立全自动生化仪、超声波体外碎石机、口腔全景机等先进医疗设备，尽可能为患者营造一个良好的就医环境。

近年来，通过与上海长海医院、湖州市中心医院、湖州第一医院、湖州市中医院等知名医院协作，选派医院业务骨干到上海华山医院、新华医院进修学习，使医院整体水平不断提高，业务迅速发展，其中中医内科、中医妇科、儿科、针灸推拿科、骨伤科、手外科等特色优势专科在本地区享有极高声誉。专科建设成效显著，针灸科为省级重点专科，中医骨伤科为市级重点专科（2016年新认定），中医儿科为区级重点专科，中医咳嗽专病为市级重点专病。医院科研能力不断提升，检验科、骨科申报的两个市级科研项目2016年已通过结题验收，填补全区卫生系统科研空白。

根据《中医药法》、《中医药发展战略规划纲要（2016—2030年）》等要求在县级区域建设好一家公立中医院，积极谋划医院异地新建和更名工作。2017年4月，南浔区政府常务会议及四届区委第10次常委会讨论并原则通过南浔区中西医结合医院异地新建方案，按照“医养结合”与南浔区社会福利中心同步设计配套建设。在区委区政府和区卫计局的正确领导下，医院坚持“立足当前、考虑发展、适度超前”原则，与区人民医院错位发展，谋划建设成为特色鲜明的区级中医院。目前医院选址已基本完成，用地约70亩，按照三级乙等中医院450张床位标准规划，总投资约6.66亿元，整体方案设计阶段正在进行中。