安徽医科大学第二附属医院口腔科位于门诊楼首层，占地约800平米，拥有综合治疗椅22台。学科是一支以医学博士、硕士为主体的技术骨干团队，在临床、科研方面取得优异成绩，为安徽省住院医师规范化培训基地。

科室具有德国KAVO口腔锥形束CT机，INSTRUMENTARIUMFOCUS数字牙片摄影系统，丹麦3-Shape口内扫描仪，德国徕卡根管显微镜，美国宝镭适水激光治疗仪等先进设备。

科室以口腔种植为核心技术，引进多种国际知名种植系统，具有先进的医疗技术和设备，解决患者骨量不足及美学问题，为患者提供多种类型的种植义齿修复。

口腔内科常规开展龋病、牙髓病的充填治疗，根管治疗，显微根管治疗术，年轻恒牙牙髓病的保存治疗，根尖手术等；同时进行牙周炎的序列治疗，松牙固定，牙周牙髓联合治疗，牙周正畸联合治疗，牙周膜龈手术，及口腔黏膜常见病的诊治。

修复科开展口腔软硬组织缺损的修复，残根、残冠的保留，如全瓷冠、瓷贴面、瓷嵌体，贵金属修复体，可摘活动义齿，CAD/CAM即刻修复，精密附着体，牙齿美学修复，咬合重建等。

正畸科以儿童颜面值管理为特色常规开展各种早期预防和阻断性矫治，功能矫形治疗，及各类固定矫治，隐形矫治，牙周病矫治，颞颌关节病矫治等。口腔外科开展阻生齿拔除，微创拔牙，外伤清创缝合，颌骨骨折，颌面部炎症，肿瘤的诊治等。