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女性甲亢吃药最常见的副作用就是胃肠道反应，还有转氨酶升高、白细胞减少、药物过敏。具体如下：1、胃肠道反应：比如恶心、没有食欲，因为所有的药物服用后，首先会到达胃肠道，所以有时可能会有胃肠道的不良反应；2、转氨酶升高：因为治疗甲亢的药物，不论是丙硫氧嘧啶，还是甲巯咪唑，或多或少个体差异是有人会产生转氨酶升高或者胆红素聚集，转氨酶升高的问题主要见于丙硫氧嘧啶，引起胆红素问题的主要是甲巯咪唑，但有时甲巯咪唑也会引起转氨酶升高，包括碱磷酶升高，在使用过程中主要还是和个体差异敏感性非常有关系；3、白细胞减少：也有个体差异，在使用过程中可能会对骨髓有一过性抑制，但如果属于特别敏感的个体，甚至可能会出现粒缺(粒细胞缺乏症)，会影响病人伴发严重的感染；4、药物过敏：相对过敏几率不是很大，但是如果是个体特别敏感的女性，有些患者可能也会有药物过敏。