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碘伏与莫匹罗星均具有抗菌消毒的作用，可以同时使用。但在使用时要注意顺序，一般先涂抹碘伏进行局部伤口的消毒、清创，然后再涂抹莫匹罗星。碘伏对于细菌、真菌、病毒以及芽孢，均能起到杀菌的作用，主要是依靠分子碘能够杀灭病原菌的功效。莫匹罗星是抗菌药物，在临床上使用更多的是软膏剂，主要是对细菌能够起到一定的杀灭作用，主要针对革兰氏阳性球菌。皮肤比较容易发生的是阳性球菌的感染，因此莫匹罗星可以用于局部的小面积创伤感染。