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通常用于检查和治疗目的的胃镜，对人体损害较少甚至可以忽略不计。胃镜为较安全的检查和治疗方式，但胃镜检查为有创性操作，在此过程中可能存在一定并发症，但一般情况下，不会对胃部造成损伤。部分患者可能造成咽喉部黏膜擦伤，如果进行胃镜检查对病变位置需要进一步取活检送病理时，此过程中可能对胃黏膜局部造成医源性损伤。但胃黏膜修复能力较强，如为较小损伤可能在较短时间内，如1-2天趋于缓解。如为小溃疡可能需要几周时间可以完全愈合。如果为缓解病症、进一步治疗疾病，如胃癌早期切除后，可能需短期复查，观察溃疡愈合情况，此种情况下，胃镜检查操作较频繁。