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所谓霉菌性肠炎，其实就是真菌性肠炎，治疗办法有：1、抗真菌药物：主要是杀灭真菌，主要有抗真菌的药物。抗真菌的药物，包括常见的金霉素，稍微少见一些像大扶康，都可以达到抗生菌的作用；2、调节肠道微环境：同时可以用调节肠道微环境，用益生菌去抑制真菌生长；3、支持治疗：产生霉菌性肠炎一般是有原因的，见于病情相对比较重、危重的患者或者长期使用抗生素、过量使用抗生素，导致肠道的菌群环境被破坏，从而引起真菌繁殖。像这类病人治疗原发病也很重要，比较好的支持治疗，让身体状态得到恢复，自己产生抵抗力。另外，就是要加强肠道内环境的调整，最后才是抗真菌治疗，包括制霉素、大扶康，都可以起到治疗霉菌性肠炎的作用。所以对于霉菌性肠炎，抗真菌治疗、改善微生态的治疗和支持治疗都比较重要，能够帮助治疗霉菌性肠炎，并且得到恢复。预防也很重要，病情比较危重时容易出现霉菌性肠炎的改变。