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游离三碘甲状腺原氨酸偏低的原因大概分为以下几种：1、原发性的甲状腺功能减退；2、由于其他的疾病，如心肌梗死、创伤应激等，出现代偿性的甲状腺功能减退，这种情况也会出现游离三碘甲状腺原氨酸的降低；3、垂体功能不足也会出现游离三碘甲状腺原氨酸降低，属于比较少见的情况。在这当中最常见的就是原发性的甲状腺功能减退，目前发病率逐渐升高。其主要的原因是一种自身免疫性疾病，称之为慢性淋巴细胞性甲状腺炎，也叫桥本甲状腺炎。这种疾病的发病机制目前不是特别清楚，主要表现是在查甲状腺功能时会发现甲状腺功能降低，甲状腺素水平降低，游离三碘甲状腺原氨酸降低，促甲状腺激素出现负反馈性升高。其他表现是甲状腺相关的自身免疫抗体，如甲状腺过氧化物酶抗体或者甲状腺微粒体抗体升高，有了这几种实验室表现后，医生会诊断病人是原发性甲状腺功能减退。对于这种疾病，通过定期观察甲状腺功能，一旦出现甲状腺功能减退则需要口服甲状腺激素，代偿甲状腺的水平。