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双歧杆菌、三联活菌和四联活菌的区别，主要如下：1、菌种：三联活菌的菌种主要包括长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌等。四联活菌主要的菌种包括婴儿双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌，还有蜡样芽孢杆菌等；2、菌种数量：从命名上可以看出，三联活菌包括3种活菌，四联活菌包括4种活菌，本质上属于同一类药，均属于调节肠道菌群的活菌制剂，主要功效是用于治疗肠道菌群失调相关的疾病，包括腹泻、便秘、功能性消化不良等。作为活菌制剂，需注意活菌贮存，不能在高温下贮存，否则导致细菌灭活。在用药时，需注意用40℃以下的凉水或者温水、温牛奶送服，以免温度过高导致细菌灭活等。