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如果胆总管囊肿及时通过手术治疗，不会影响患者寿命，如果没有通过手术处理，胆总管囊肿癌变以后，会严重影响患者生命。胆总管囊肿是先天性疾病，在胚胎发育过程中，因为胆管壁发育不良，导致胆总管囊性改变，囊肿可以长得到十几厘米，甚至20cm。胆管下端常因为发育不良表现为牵痛创，胆总管囊肿在小孩中比较多见。如果没有得到及时有效的手术治疗，反复胆汁淤积会诱发胆管炎症，从而促使囊肿壁出现癌变。一旦发生癌变，会严重影响到患者的生命。胆总管囊肿本身是良性疾病，如果变成恶性肿瘤，其治疗与预后就会变得比较糟糕。如果通过及时有效的治疗，手术切除囊肿，将胆道进行胆脏的内引流的处理，使胆汁用过人工手段流动，使其恢复正常，就不会影响到患者的生命，患者的生活质量与生命都会表现为正常。