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囊肿和肌瘤有明显的区别，囊肿一般指卵巢囊肿，肌瘤一般指子宫肌瘤，具体如下：1、囊肿：是卵巢发生的囊性改变，可以是卵巢肿瘤，其中是囊性肿瘤，也可以是其他问题，比如生理性囊肿或子宫内膜异位囊肿；2、肌瘤：是实性病变，发生在子宫身上，可以多发的实性肌瘤，可以很大也可以很小。囊肿和肌瘤在临床上容易鉴别，到医院可以通过妇科检查进行触诊，也可以做许多影像学的检查，比如超声就很容易发现，是卵巢部位肿瘤，还是子宫肿瘤，是囊性还是实性，如果实在是不容易鉴别，还可以做CT、盆腔核磁，都可以明确的诊断。卵巢囊肿可能是生理性，也可能是病理性，需要定期复查进行鉴别，还可以查血的肿瘤标志物，进行良性、恶性的预判。