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心脏磁共振检查原理和其它部位磁共振检查原理基本上一样，磁共振工作原理基于两个重要因素，一是磁场即磁共振仪器所提供强大磁场。另外一个即是核，而核即人体组织器官细胞内广泛分布氢原子核，磁共振工作原理是将人体放置于磁共振机器强磁场中，用无线电射频脉冲激发被检查组织细胞内氢原子核，引起氢原子核共振便吸收其能量。 在停止射频脉冲后，氢原子核按照特定频率发出射电信号，并将吸收能量释放出来，这些信号通过磁共振仪器接收并记录下来，再经过一系列高能电子计算机对数据分析重建，从而形成磁共振影像，用于临床诊断。