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附件囊肿和卵巢囊肿的区别主要如下：1、附件：附件在女性生殖系统中指子宫附件，即紧靠子宫的组织，子宫两侧宫角各有一侧输卵管和卵巢，包括输卵管和卵巢。附件囊肿除卵巢囊肿以外，还包括输卵管囊肿，常见的为输卵管泡状附件以及输卵管系膜囊肿，所以附件囊肿范围要大于卵巢囊肿；2、卵巢囊肿：范围仅为卵巢囊肿，也是常发生的囊肿，包括生理性和病理性。生理性卵巢囊肿通常经过数个月观察可能消失。病理性卵巢囊肿包括上皮性、性索间质、生殖细胞，还有转移性的卵巢肿物。此外还有盆腔子宫内膜异位导致的卵巢巧克力囊肿，主要是由于子宫内膜逆行，经血逆流所致，通常会引起痛经等表现。