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大便的标本通常要求1小时内送检，此时检查的结果才相对真实可信，能够反映出肠道微生态变化的真实情况，如果超过1小时建议重新留取。检测大便时需观察其性状、颜色、大便中微生物等，比如是否存在致病菌、寄生虫，了解杆菌、球菌的比例，以及是否存在白细胞、红细胞等异常情况。当大便中的微生物离开人体肠腔的环境进入自然环境中，需接触空气、压力、温度以及湿度等，均可能对微生物产生影响。如厌氧菌在肠腔内处于厌氧的环境，留取标本后厌氧菌处于自然状态下就不是厌氧的环境，可能很快就会死亡或崩解，可能导致检测不到此类微生物。