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胎儿染色体异常的原因通常包括以下几点：1、胎儿自身发育异常：通常可以导致胎儿染色体数目异常，如21-三体，若受精卵形成时分裂出现异常，则会导致21-三体等异常情况的出现。而胎儿染色体微缺失、微重复等结构异常多数是在染色体形成过程中或受精卵分裂的过程中发生的轻微异常；2、父母双方染色体异常：胎儿染色体异常在个别情况下与父母双方相关，因为父母双方也可能带有微缺失或微重复的染色体。如果通过检查发现父母双方染色体虽然存在异常，但未发生异常表型，则微缺失、微重复属于正常现象，则可以继续妊娠；3、基因突变：若排除上述情况，则属于胚胎发育过程中发生基因突变所致，应及时终止妊娠以免出现异常表型。