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HPV4价疫苗比HPV2价疫苗多了一个防性病的功能，但是它们的防癌效果是一样的。HPV4价疫苗和HPV2价疫苗能防癌的原因，是都能够针对HPV16和HPV18型，这两型致病能力较强，可以导致七成左右宫颈癌的发生。HPV4价疫苗比HPV2价疫苗还多一个功能，就是预防HPV6和HPV11这两种的低危型，低危型HPV6和11不是导致宫颈癌，而是导致生殖器疣的类型，所以两者防癌效果基本一致。如果疫苗特别紧缺的话，注射哪种都可以，因为防癌效果是最主要的，其它的只是附带。对于一个个体而言预防7-8成，还是预防8-9成的宫颈癌其实效果是差不多的。HPV疫苗重要的影响因素还包括年纪，越年轻疫苗的反应越好，接种效果也越好。另外就是HPV感染前接种效果会更好，HPV疫苗是指预防没有感染过的HPV的型别，如果已经感染了某种HPV型别再接种相关疫苗对其是没有作用的。