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人体或者环境中的细菌，主要根据革兰染色分为革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。革兰氏阳性菌，在人体的体表或者环境中都可以见到。一般来说，革兰氏阳性杆菌的致病性少，条件致病性或者非致病性的相对较多。肠道里大多数革兰氏阳性杆菌是厌氧菌，酸奶里面的细菌也是革兰氏阳性杆菌，跟革兰阴性杆菌有区别。患者在医院里发生感染后，经常会培养到革兰氏阴性杆菌，像大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌，其都是革兰氏阴性菌。厌氧菌，如艰难梭菌或者其他芽孢杆菌都是革兰氏阳性杆菌。