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患者出现头痛、腹泻，可能有以下原因：1、嗜神经病毒感染：患者出现神经炎的时候会引起植物神经功能紊乱，导致出现头痛、腹泻；2、肠道病毒感染：迷走神经与痛觉神经相关，诱发头痛；3、大脑病变：如颅内压增高、脑积水、脑炎、脑肿瘤、脑梗死、脑出血；4、其他：原发性头痛、偏头痛、丛集性头痛、继发性头痛、鼻窦炎、颞动脉炎。