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血吸虫病根据病程分为急性血吸虫病、慢性血吸虫病和晚期血吸虫病。急性血吸虫病的治疗以住院治疗为主，对症治疗以及给予抗血吸虫病的药物，吡喹酮口服6日疗法，很快会恢复健康。对于慢性血吸虫病，主要给予口服吡喹酮2日疗法，并辅助以护肝、改善肠道循环治疗，轻中度患者治愈率可达80%，重度患者治愈率可以达到70%。晚期血吸虫病的治疗，主要是以治疗其并发症为主，包括肝硬化、消化道出血等严重并发症的治疗。血吸虫病治疗需杀虫2-3次，虫卵容易沉积在肝脏和肠道，导致肝肠循环障碍、肝肠纤维化，从而可能会引起肝脏和肠道的肿瘤，治疗需定期护肝、改善肠道循环。血吸虫病的治疗效果，主要与接触疫水次数、接触疫水时间、接触疫水面积以及感染程度相关，急性轻症的及时治疗可以治愈；严重感染、反复感染或治疗不及时，可能发展为慢性或是晚期血吸虫病，需要长期治疗。