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医学上认为肛瘘主要病因是由于肛腺感染所导致的，所谓肛腺是肛门和直肠交界部位的一个特殊组织结构。举个例子，皮肤上有汗腺，汗腺感染会形成老百姓所说的疖子，当肛腺感染以后，就会形成肛肠科常见的肛瘘及肛周脓肿。当肛周脓肿向周围扩散，从肛门周围破溃、流脓就形成了肛瘘。肛瘘的发病原因是由于肛腺感染所导致的。能够诱发肛腺感染的因素往往包括，比如长期过度食用辛辣食物、腹泻、大便次数增多，或者大便干燥，这些不良生活习惯或者其它疾病都可以引发肛瘘的发生，这是平常生活中需要注意的。如果发现患有肛瘘，首先需要到正规医院就医，通过正规的治疗可以达到很好的治愈效果。肛瘘一般需要通过手术来治疗，药物治疗可以起到缓解作用，但是最终大部分肛瘘是需要通过手术来治疗的。