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A群流脑疫苗的不良反应比较少见，发生的几率比较低，而且比较轻微。可以出现的不良反应，有注射局部的红、肿、热、痛，即局部不适，其次会有低热，最后可能会出现一些过敏反应，如全身出皮疹，嗜酸性粒细胞增高或过敏性发热等，这是A群流脑疫苗出现的不良反应。这个不良反应通常出现在注射疫苗后的24-48小时内，而且不良反应比较轻，一般情况下不需要处理，发热通常也是在38℃之内。极个别患者，如果体温超过38℃，或皮疹比较多，或患者的症状比较明显或比较严重，这种情况比较少见，如果出现这种情况，需要带患者到医院就诊。除此之外，如果这种反应比较轻微，持续时间又短，便不需要特殊处理。流脑是由脑膜炎奈瑟菌，通过呼吸道感染进入人体以后，导致的一个中枢神经系统的感染性疾病，所以这个疾病患者有发热、皮疹，以及神经系统的症状，此疾病比较严重，最好的预防办法是注射流脑疫苗。流脑疫苗有很多种，有A群流脑疫苗、A+C群流脑疫苗，以及A+C+Y+W135群流脑疫苗这种种混合的流脑疫苗。对于A群流脑疫苗而言，主要预防的是由A群脑膜炎奈瑟菌导致的流行性脑脊髓膜炎，对其他血清群的脑膜炎奈瑟菌引起的流行性脑脊髓膜炎没有效果，仅预防A群脑膜炎奈瑟菌感染导致的流行性脑脊髓膜炎。