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上呼吸道感染病原体最常见的应该是病毒，各方面的统计资料显示，上呼吸道感染病毒导致的可能性在80%以上。近年来，尤其是从2003年以来，不同时期出现的各种急性呼吸道传染病，都是病毒，只是SARS、MERS、新型冠状病毒感染，是上呼吸道感染中一个比较突出的传染病。除上述传染病之外，临床经常看到的上呼吸道感染的感冒，都是各种不同的病毒导致。由于是病毒，各种抗生素治疗效果不好，在上呼吸道感染的过程中，病程可能会延长。尤其是乱用药的过程中，使病程进一步延长，混合感染的相继出现，可能是导致上呼吸道感染进一步加重，波及到下呼吸道最常见的原因。上呼吸道感染除了病毒以外，可能有衣原体、支原体、卡他莫拉菌、流感嗜血杆菌、军团菌等。除此以外还可能是溶血性链球菌、肺炎链球菌，可能还会有别的病原体，但是大多数情况下，上呼吸道感染是病毒感染的发生率比较高。所以普遍上呼吸道感染症状不严重，或者即便严重，主张不要随意的使用抗生素，多喝水、多休息，适当用中成药。可以用市面上的抗病毒药来缓解，但是由于抗病毒药物的疗效不确切，临床起到效果的作用不是很大，很多患者可能是通过物理治疗、休息、多喝水等达到自愈。