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治疗便秘常用的益生菌是双歧杆菌、乳酸菌等，治疗便秘需要区分引起便秘的原因，不同病因需要进行不同治疗，具体如下：1、功能性便秘：可能和生活方式、进食食物的情况以及肠道微生态紊乱有关，这类病人应该进行生活指导，加用肠道调节菌群的药物，如双歧杆菌、乳酸菌等；2、器质性病变：如肠癌、肠息肉等，也可以导致便秘，需要对原发病灶进行治疗；3、肠外疾病：如脑梗塞、糖尿病、甲状腺功能低下，腰、骶椎神经病变等，都可以导致便秘，需要治疗基础疾病。便秘病人需要明确病因，长期便秘的病人可能需要做肠镜检查以明确诊断。