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目前针对乙肝病毒的清除没有特效药，但现有的抗乙肝病毒药完全可以控制住乙肝病毒的复制，使病毒不再侵害肝脏，使肝脏的病变停止进展，防止肝硬化，降低晚期肝脏病的发生概率，以及晚期肝脏病所导致的致命性并发症的发生率。针对乙肝病毒的抗病毒药，目前疗效已经不错，但清除乙肝病毒目前还达不到。目前国际公认的抗乙肝病毒的药包括核苷类似物，如恩替卡韦、替诺福韦，对于控制乙肝病毒复制都强而有效，通常在半年左右的时间，能把DNA控制在最低检测线以下，从而使肝炎停止进展，防止肝脏病继续进展。另外的药物是干扰素，包括短效干扰素、长效干扰素，都能够降低表面抗原，降低DNA，使肝脏的炎症逐渐停止进展。这两类药物也可以联合使用，能够最大程度抑制病毒复制，阻止病情的进展。