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维生素B6主要用于预防和治疗维生素B6缺乏症，如脂溢性皮炎、唇干裂，减轻妊娠、抗癌药物和放疗引起的呕吐，治疗婴儿惊厥，或给孕妇服用来预防婴儿的惊厥，可以治疗白细胞减少症。维生素B6在红细胞内可以转化为磷酸吡哆醛，对蛋白质、糖类、脂类代谢起着很重要的作用。 长时间服用异烟肼，也易引起周围神经炎、失眠不安，这症状也可以用维生素B6来治疗。还有全胃肠外营养以及摄入不足导致的营养不良，进行性体重下降的时候，可以进行维生素B6的补充。需要注意的是维生素B6虽然是比较安全的药品，但每天服用剂量比较大，如服用了200mg以上，而且持续时间比较长，也有报道可以产生维生素B6依赖综合征。