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C-反应蛋白升高最重要的临床意义，是对感染有提示作用且能作为感染的鉴别指标，尤其细菌感染会出现C-反应蛋白的明显升高，病毒感染不会出现C-反应蛋白升高或仅轻度升高。C-反应蛋白升高的原因较多，C-反应蛋白是机体受到感染或组织损伤时，血浆中部分急剧上升的急性期反应蛋白激活补体和加强吞噬细胞的吞噬，而起调理作用。清除入侵到机体的病原微生物，和损伤、坏死及凋亡的组织细胞，在机体的天然免疫过程中，发挥着重要的保护作用。还可见于风湿免疫系统疾病的活动期，能够监测疾病是否处于活动期，比如类风湿性关节炎C-反应蛋白可以明显升高，而且其高低与临床症状、治疗效果密切相关。此外，还可见于重大的应激创伤手术后，此时人体内有组织损伤和炎症存在，可能会出现C-反应蛋白的升高。