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新生儿真菌感染，主要是新生儿各个脏器或系统感染了真菌，导致真菌繁殖引起，具体如下：1、鹅口疮：主要是白色念珠菌感染或奶瓶护理方式不当，导致真菌的繁殖，比较多见。部分长期住院的新生儿，由于长期使用抗生素，引起整个肠道、胃肠道的菌群紊乱、菌群失调，导致真菌繁殖，引起鹅口疮，临床也比较多见；2、细菌性败血症：部分新生儿抵抗力较差，特别是长期住院的早产儿，留有中心静脉置管，需要进行静脉营养，应用抗生素进行治疗，此时容易引起菌群的紊乱，也容易引起细菌性的败血症；3、菌群失调：菌群失调导致的真菌感染，可以引起肺部的真菌感染，肠道的真菌感染会出现菌丝，可在大便中检测；4、肺部感染：肺部可出现白色念珠菌、隐孢子虫等感染，严重可引起神经系统的真菌感染。为了避免和预防真菌感染，临床上常需要口服或静脉应用达肤康等抗真菌药物，对真菌感染加以控制。鹅口疮、白色念珠菌等感染，常需要口服制霉菌素或达肤康，也可将药片碾碎，加用温水或生理盐水，用棉签蘸取涂抹口腔，1-2天后病情可能会有所好转。