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沙眼的感染，是由于沙眼衣原体对结膜和角膜的慢性持续感染，造成的慢性结角膜炎。如果经过有效的治疗，需要大概数年时间才能转阴，如2-3年或者3-4年。沙眼衣原体是介于病毒和细菌之间的微生物，它的活力很强，目前很难用药物杀死。由于现在大量广谱抗生素的应用，对沙眼衣原体有抑制作用，所以一般会反复长期的用眼药水来抑制沙眼衣原体，同时可以采取物理的方式，比如对已经感染过的结膜或者角膜进行刮痧治疗，来破坏沙眼衣原体已经创伤的创面。一般经过数年的有效治疗，沙眼衣原体就会转阴，同时转阴也有赖于人体抵抗力的增强，如果生活、营养，包括生活卫生的条件环境改善，用眼也很少，一般经过2-3年或者3-4年，就能最早或者尽快使沙眼衣原体转阴。