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下丘脑错构瘤严格来说并不是一种真正的肿瘤，而是在下丘脑部位的结节状的异位灰质。由于这种异位灰质常会引起患者出现比较典型的临床症状，而通过药物治疗效果又不理想，所以手术治疗是比较理想的方法。在手术过程中，如果进行肿瘤全切，术后复发的风险很低或者说在很大程度上是不会复发。但是由于这个部位神经结构比较复杂，有时术中也难以明确辨认肿瘤的边界，所以只能进行肿瘤的大部分切除，以最大限度的保留患者的神经功能，在这种情况下，肿瘤就有可能复发。但是总体来说，下丘脑错构瘤基本上不太生长或者生长十分缓慢的肿瘤，所以完全的复发风险或者进展很快的风险比较低。在通过手术方法进行大部切除之后，患者的顽固性癫痫也更容易通过药物控制，在随访过程中一般残留的肿瘤是长期保持稳定，不会在短时间内迅速复发，或者出现相应症状的进展。