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小孩进行核磁共振检查对身体没有损害，具体如下：1、核磁共振属于氢原子成像技术合成影像，并非X线射线，没有辐射，对小孩没有影响，较为安全；2、核磁共振一次只能检查一个部位，所需时间较长，大概每个部位需半小时，小孩年龄小且配合度较差，大部分情况需要口服镇静药物，镇静药物可能对小孩存在影响；3、运动较快的器官不能进行核磁共振检查，如心脏或肠道、空腔脏器、肺脏等，需进行X线或其他检查。所以孩子可以放心进行核磁共振，但大部分情况下需要镇静，而且每次检查大部分只能做一个部位，如果做两个部位，所需要时间可能更长，可能产生一定影响。但如有必要，必须进行核磁共振检查。