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胚胎移植技术是体外受精胚胎移植技术的第二个环节，也是最重要的一个环节。它是在体外对胚胎进行3-5天的培养之后，选择形态比较好的胚胎，把它重新放回女性宫腔内的一个过程。 这个过程是在B超监控下进行操作的，胚胎移植所用的移植管是一个非常细、很软的管子，会把含有胚胎的培养液吸进移植管内，由胚胎室的胚胎学家转移到临床医生手中，在B超监控下把它缓缓的放到女性体内。 胚胎移植目前来说如果是移植第三天的胚胎，会选择1-2枚胚胎，常规情况下是两枚胚胎进行移植。 如果是移植囊胚也就是5-7天的胚胎，会选择评分比较好、质量比较好的胚胎，常规情况下是进行单囊胚移植，因为囊胚移植相对于第三天的胚胎来说，种植率要高。 因为囊胚培养比第三天的胚胎在体外又多经过了2-4天的一个培养和筛选过程，能够形成囊胚的肯定是经过优选的胚胎，所以妊娠率会相对比较高，为了避免双胎或者是双胎以上的妊娠，会选择单囊胚进行移植。