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隐匿性乙肝是特殊乙肝病毒感染状态，仍可出现肝炎活动而使肝脏受损，引起肝细胞炎症、坏死、损伤，肝功能可表现为转氨酶升高。隐匿性乙肝时化验常规乙肝病毒标志物，如乙肝五项，表面抗原是阴性，但HBV-DNA阳性提示病毒复制水平可达到1×104、11×105甚至以上。此时说明乙肝病毒合成表面抗原的基因发生变异，不能合成表面抗原，所以呈阴性，通常可排除乙肝病毒现症感染。但有极个别患者有乙肝病毒感染时，表面抗原是阴性，即病毒编码表面抗原区域发生变异，不能合成表面抗原。此时病毒仍可以大量复制，化验DNA可呈阳性，肝功能可提示肝脏受损。