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巧克力囊肿属于子宫内膜异位症，导致发生的风险因素主要包括：1、未经产女性；2、长时间暴露于内源性激素，如月经来得早11-13岁初潮、大于55岁绝经、月经周期较短小于27天、月经量较多等；3、缪勒斯管发育异常，可能与子宫畸形，如纵隔子宫、鞍状子宫，导致流出道异常；4、激素药物摄入过多；5、在儿童时期或青春期，受过严重的生理或者性虐待；6、有大量摄入反式不饱和脂肪酸。与子宫内膜异位症风险降低的因素包括多产、哺乳期延长，还有月经初潮比较晚。