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由于双胎妊娠唐氏筛查的检出率较低，而且假阳性率较高，目前并不推荐单独使用血清学指标进行双胎妊娠的唐氏筛查。双胎的唐氏筛查推荐早孕期多项指标及多种筛查手段的联合应用，以提高检出率。早孕期的超声筛查在孕11-13周+6进行，检查染色体疾病的相关软指标，如胎儿颈项透明层厚度，鼻骨及静脉导管等，尽可能发现严重的胎儿畸形，如无脑儿、单心室、胎儿严重水肿。双胎妊娠在有经验的产前诊断机构可以进行无创DNA检测，根据文献报道，双胎的无创DNA检测对21-三体综合征的检出率目前可以达到90%以上，假阳性率极低，其筛查效能明显高于传统筛查方法。