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双胎妊娠的孕妇也属于无创DNA检测的慎用人群，目前无创DNA主要还是适用于单胎，无创DNA检测的准确性与胎儿游离DNA的数量密切相关，单卵双胎遗传物质一致，在胎儿游离DNA总浓度达到4%时便足以进行检测，与单胎相似。而双卵双胎染色体核型常不一致，如果异常胎的游离DNA低于临界值4%，正常胎儿的DNA量又足够多，总浓度的游离DNA量达到了检测所需要的最低值，检测结果可能因为正常胎掩盖异常胎而提示为低风险，可导致漏诊的发生。因此医生需告知双胎妊娠的孕妇进行无创DNA，其检出率下降，假阴性率上升，孕妇权衡利弊并明白风险，还是可以选择进行无创DNA检测。