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病毒性脑炎的治疗方法包括对因治疗、免疫治疗以及对症处理。其中抗病毒治疗，其选药可能有一定的变化，如单纯疱疹病毒引起的脑炎，可选用阿昔洛韦治疗，而EB病毒引起的脑炎，则选用更昔洛韦治疗。对症处理，即头痛则予以止痛，有颅高压症状则予以脱水，发烧则予以降温，包括物理降温和用药。免疫治疗即使用药物增强免疫力。